
如果實驗設計不嚴謹——以漸凍人症轉基(jī)因小鼠藥物研發為例(lì)
肌萎縮性脊(jǐ)髓側索硬化症
因中樞神經係統內控製骨骼肌運動(dòng)的神經元退化導(dǎo)致(zhì)的肌萎縮性脊髓側索硬化症(Amyotrophic lateral sclerosis: ALS,也稱(chēng)漸凍人症)是一種漸(jiàn)進且致命的神經退行性疾病。由於運動神經元退化和死亡,肌肉逐漸萎縮致(zhì)大腦完全喪失控製隨意(yì)運動的能力,最終(zhōng)會造成發音、吞咽(yān),以及呼吸(xī)和運動障礙。著名物理學家霍金就是一名ALS患者。目前還沒有真正可有效治療ALS的藥物和方法。
絕(jué)大多數(90-95%)的ALS發病原因不明,但也有約5-10%的ALS患者表現出了(le)家族遺傳性,其中超氧化(huà)物歧化酶 1(Superoxide Dismutase 1:SOD1)基因突變約占(zhàn)這些遺傳性ALS病例的10%。SOD1也是第一個被鑒定出(chū)來的(de)ALS風險基因(yīn)[1],因此很快就(jiù)有科學家構建了一種含有第93位甘氨酸突變為丙氨酸(G93A)的人SOD1基因的轉基因小鼠模型(xíng),全名為B6SJL-Tg(SOD1*G93A)1Gur/J轉基因小(xiǎo)鼠[2]。該轉基因小鼠基因組中被(bèi)轉入了23個拷貝的人源SOD1*G93A突變基因,接下來我們將其簡稱SOD1*G93A轉基因(yīn)小鼠。
圖二:SOD1*G93A轉(zhuǎn)基因小鼠是以B6和SJL雜交子代為背景品係,通過原核注射(shè)和(hé)胚胎移(yí)植得到的轉基因小鼠模型,因此其毛(máo)色多樣,圖片來自Jax實驗室(https://www.jax.org/strain/002726)
自1996年SOD1*G93A轉基因小鼠問世以後,其就被廣泛應用於(yú)ALS藥物研發的臨床前動物試驗中。到2004年,短短(duǎn)8年時間內,已至少有50篇文章描述了從小分子到病毒載體的各類ALS治療方案,可延長SOD1*G93A轉基因小鼠(shǔ)的壽命,其中最長可以延(yán)長壽命100天(78%的壽命(mìng)延長)。這些藥物很快進入臨床試驗,然而,迄今為止,除(chú)了利魯唑(最多延(yán)長ALS患者兩個月壽命)之外,沒有任何一種藥物顯示出對人類ALS疾病(bìng)的進程有顯著影響[3]。這給醫藥公司帶來了巨大損失,如2008年在美國國家科學院院(yuàn)刊上發表的一篇文章顯示鋰可以將SOD1*G93A轉基因小鼠的存(cún)活時間延長30天[4]。由於鋰(lǐ)早已經(jīng)被用於治療精神分裂症,許多ALS患者開始超說明書服用該藥物,希望減緩疾病進程。然而,招募了數(shù)百名患者,花費了遠超1億(yì)美元的三個同時啟動的獨立III期臨床試驗結果卻顯示鋰對ALS無任何治療效果。
其(qí)實不僅僅是ALS的藥物(wù)研發,在整個醫(yī)藥研發領域(yù),動物實驗結果(guǒ)的平(píng)均臨床轉化率也是(shì)非(fēi)常低的,平均在11%左右(yòu) 。那麽到底是什麽原因導致了如此高比例的動物實驗結果無(wú)法實現在(zài)人類(lèi)的(de)臨床轉化呢(ne)?
1999年,美國麻(má)省理工學院(yuàn)的機械(xiè)工程師詹姆斯·海伍德在得知他(tā)的(de)哥哥史蒂芬(fēn)·海伍德被確診患有(yǒu)ALS,並無(wú)任何有效治療方(fāng)法後(hòu),與家人一起創立了一家非盈利性生物技(jì)術公司,即ALS 治療(liáo)開發研究(jiū)所 (ALS-TDI)。ALS-TDI成立後(hòu)開展了一項旨在尋找SOD1*G93A轉基因小鼠實驗結果臨(lín)床轉化失敗原因的項目,即使用SOD1*G93A轉基因小鼠重(chóng)複已發表科研論(lùn)文中的動物實驗,以找出其臨床轉化失敗(bài)的原因。
在(zài)ALS-TDI開(kāi)展的重複性實驗中,他們不僅嚴格執行盲法對照,而且對給藥組和對照(zhào)組的動物進行了更為精細的分配和動物篩查以(yǐ)排除(chú)係統誤差。他們分組及實驗要求包括:
⑴ 年齡匹配;
⑵ 性(xìng)別匹配;
⑶ 同窩(wō)匹配:即(jí)使(shǐ)用同一天出生的同一非轉基因母親和轉(zhuǎn)基因父親的後代進行分(fèn)組,具體來說(shuō),治療組中的每個雄性(和雌性)在對照組中都有(yǒu)一個同(tóng)窩兄弟(和姐妹);
⑷ 樣本量設定:每組使用動物數量為24隻(12雌,12雄);
⑸ 死因篩(shāi)查:檢查記錄每一隻動物的死亡原因,排出非ALS致死個體;
⑹ 轉基因拷貝數監控:有研(yán)究證明SOD1*G93A轉基因小鼠在(zài)傳代過程中會出現轉基因拷貝(bèi)數丟失的現象,且低拷(kǎo)貝的轉基因小鼠的平均壽命會加長。
在這一嚴格實驗分組和動物篩(shāi)查條件下,ALS-TDI的科研人員總共使(shǐ)用了(le)5429隻SOD1*G93A轉基因小鼠測試了包括利魯唑(zuò)在內的100多種(大部分已有論文發表並證明可延長SOD1*G93A轉基因小鼠壽命)候選化合物,卻沒有發現任一化合物表現出可延長SOD1*G93A轉基因小鼠壽命的效(xiào)果(圖三)。
圖三:ALS-TDI以SOD1*G93A轉基因小鼠(shǔ)開展(zhǎn)的重複實驗結果與(yǔ)已發表實驗結果對比[3]
為找(zhǎo)出導致那些已經發表實驗結果無法被重複的原因,他們以在ALS-TDI開展實驗(yàn)中所使用的2000多隻對照小鼠作為(wéi)研究對象(xiàng),進行了計算機分組模擬實驗。由於這(zhè)些(xiē)小鼠從出生到死亡及死亡原因的(de)信息在ALS-TDI都有詳細的記錄,因此他們能夠以所有對照小鼠為(wéi)數(shù)據庫,分析前述重複實驗(yàn)中設定的不同分組和動物篩查條件(jiàn)對實驗(yàn)結(jié)果的影響。即通過計算機對這些沒有經過任何藥物處理的小鼠進行分組,將(jiāng)一組設為假定的(de)實驗組,而另一組設為假定的對照組,然後依據已有的小鼠死亡時間記錄,統計兩組小鼠之間是否存在顯著差異。經過多次重複,計算出現5%以(yǐ)上顯著差異的百(bǎi)分(fèn)比。由於這些(xiē)對照小鼠(shǔ)沒有接受過任何化合物處理,因此如果假定(dìng)的(de)實驗組和對照組中出現了顯著性差異,那麽其來源應該是分組時的係(xì)統(tǒng)誤差(chà)。
結果顯示,在樣本量大小為4的計算機分組模(mó)擬對比實驗中,在隨機分組和不進行死(sǐ)因篩查及(jí)排除低轉基因拷(kǎo)貝數個體(tǐ)條件下,兩組(zǔ)間出現顯著差異的可能性超過了50%。而隨機分組的同時進(jìn)行死因篩查並排(pái)除低轉基因拷貝數個體(tǐ)和進行(háng)性別匹配的分組條件下,樣本量為4的模擬分組實驗中也有(yǒu)30%的可能出現兩組(zǔ)死亡時間的顯著差異(圖四(sì))。隨著樣(yàng)本量的增加,出現顯著性差異的可能性逐漸減少,但要實現低於(yú)5%(統計學上通(tōng)常設置的(de)顯著置信區間)的顯著性差(chà)異,樣本量要達到每組24隻(zhī)動物。如果不做分(fèn)組(zǔ)條件控製,即使樣(yàng)本量到50隻也難以排除(chú)係統誤差。
圖四:分組條(tiáo)件導(dǎo)致的係統誤差[3]
ALS- TDI的這個計(jì)算機模擬實驗結果說明,前述那些已經發表的基於SOD1*G93A轉(zhuǎn)基因小鼠實驗結果無法實現臨床轉化(huà)的真正原(yuán)因極(jí)大可能源於其實驗(yàn)設計的不合理。這些(xiē)實驗因為沒有排除分組時的係統誤差而導致了假陽性結果(guǒ)。這個研究也暴露了當下使用實(shí)驗動物開展研究(jiū)的諸多問題,如盲目地追求減少使用動物的數量;對所用動物遺傳、微生物和繁殖等特性不了解;實驗(yàn)過程中對動物關注(zhù)不夠,不清楚動物發病或(huò)死亡的真正原因等。這些問題不(bú)僅僅需要引起實(shí)驗動物從業人(rén)員的注意,科研人員同樣需要給予關注(zhù)。因為實驗(yàn)設計不嚴謹導致的假陽性結果不僅是人力、物力和財力的巨大浪費,也嚴重(chóng)有(yǒu)違動物實驗倫理福(fú)利,這樣的實驗不會帶來科學進步,且浪費了大量實(shí)驗動物的生命。比如在ALS-TDI開展的無(wú)法重複(fù)出已發表結果的實驗中,那些已經發表(biǎo)的工作累計使用小鼠的數量就超過(guò)了(le)18000隻。此外,在(zài)動物實驗倫理申請時常用替代、優化和減少(俗稱3R原則)原則來指導倫理審查(chá)工作,有時為了滿足3R原則(zé)中的“減少”原(yuán)則,加上開展(zhǎn)實驗成本的(de)考慮,往往選擇使(shǐ)用最少的(de)動物數量(比如多為(wéi)每組6隻),但從ALS-TDI的這(zhè)個研究看,樣本量過小,會導致係統誤差加大,因(yīn)此極(jí)大可(kě)能出(chū)現假陽(yáng)性結果。這個(gè)時候大家或許忘了3R原則(zé)使用的大前提是要能夠實現擬開展實驗(yàn)的科(kē)學目(mù)標,如果單純(chún)為(wéi)了(le)“減少”而使用更少的實驗動物導致科學目標(biāo)無(wú)法實現,那(nà)不是減少,而(ér)是對動物(wù)生(shēng)命(mìng)的漠視。
參考文獻:
1.Rosen DR, Siddique T, Patterson D, Figlewicz DA, Sapp P, Hentati A, Donaldson D, Goto J, O'Regan JP, Deng HX, et al.: Mutations in Cu/Zn superoxide dismutase gene are associated with familial amyotrophic lateral sclerosis. Nature 1993, 362:59-62.
2.Tu PH, Raju P, Robinson KA, Gurney ME, Trojanowski JQ, Lee VM: Transgenic mice carrying a human mutant superoxide dismutase transgene develop neuronal cytoskeletal pathology resembling human amyotrophic lateral sclerosis lesions. Proc Natl Acad Sci U S A 1996, 93:3155-3160.
3.Scott S, Kranz JE, Cole J, Lincecum JM, Thompson K, Kelly N, Bostrom A, Theodoss J, Al-Nakhala BM, Vieira FG, et al: Design, power, and interpretation of studies in the standard murine model of ALS. Amyotroph Lateral Scler 2008, 9:4-15.
4.Fornai F, Longone P, Cafaro L, Kastsiuchenka O, Ferrucci M, Manca ML, Lazzeri G, Spalloni A, Bellio N, Lenzi P, et al: Lithium delays progression of amyotrophic lateral sclerosis. Proc Natl Acad Sci U S A 2008, 105:2052-2057.
5.Kola I, Landis J: Can the pharmaceutical industry reduce attrition rates? Nat Rev Drug Discov 2004, 3:711-715.
6.Hay M, Thomas DW, Craighead JL, Economides C, Rosenthal J: Clinical development success rates for investigational drugs. Nat Biotechnol 2014, 32:40-51.